JOURNAL OF LIGHT INDUSTRY

CN 41-1437/TS  ISSN 2096-1553

基于烟草属特异性基因Ntsp151的环介导等温扩增检测

张轲 杨金初 赵旭 童治军 李萌 徐永明 张展 孙九喆

张轲, 杨金初, 赵旭, 等. 基于烟草属特异性基因Ntsp151的环介导等温扩增检测[J]. 轻工学报, 2023, 38(2): 110-117. doi: 10.12187/2023.02.014
引用本文: 张轲, 杨金初, 赵旭, 等. 基于烟草属特异性基因Ntsp151的环介导等温扩增检测[J]. 轻工学报, 2023, 38(2): 110-117. doi: 10.12187/2023.02.014
ZHANG Ke, YANG Jinchu, ZHAO Xu, et al. Detection of loop-mediated isothermal amplification based on Nicotiana-specific gene Ntsp151[J]. Journal of Light Industry, 2023, 38(2): 110-117. doi: 10.12187/2023.02.014
Citation: ZHANG Ke, YANG Jinchu, ZHAO Xu, et al. Detection of loop-mediated isothermal amplification based on Nicotiana-specific gene Ntsp151[J]. Journal of Light Industry, 2023, 38(2): 110-117. doi: 10.12187/2023.02.014

基于烟草属特异性基因Ntsp151的环介导等温扩增检测

    作者简介: 张轲(1982-),男,吉林省长春市人,云南省烟草质量监督检测站农艺师,博士,主要研究方向为制烟原料鉴别检验技术。E-mail:swukirk@126.com;
  • 基金项目: 云南省烟草专卖局(公司)重点项目(2020530000241034);河南中烟工业有限责任公司科技计划项目(ZW2015012)

  • 中图分类号: TS47;S338

Detection of loop-mediated isothermal amplification based on Nicotiana-specific gene Ntsp151

  • Received Date: 2022-12-17

    CLC number: TS47;S338

  • 摘要: 针对烟草属特异性基因Ntsp151序列保守区设计环介导等温扩增(LAMP)引物,基于SYBR Green I荧光染料对烟草材料进行可视化LAMP检测,对检测过程中的DNA提取方法和反应条件进行优化,并对LAMP反应体系的特异性和灵敏度进行评价。结果表明:使用Chelex-100提取的DNA可以直接进行LAMP扩增反应,显色效果较好;LAMP最适反应条件为扩增温度63 ℃、反应时间60 min、Mg2+浓度6 mmol/L;LAMP对17份非烟草材料和1份烟草材料基因组DNA的扩增显色结果与荧光值的检测结果一致,具有较好的特异性,其最低检测限为102 copies/μL。基于烟草属特异性基因Ntsp151的LAMP检测结果可视化强,且灵敏度高、特异性强,适用于现场抽检。
    1. [1]

      张轲,张晓伟,孙浩巍,等.基于烟草属特异性DNA分子标记的茶烟产品鉴别检验研究[J/OL].分子植物育种[2023-02-10].https://kns.cnki.net/kcms/detail/46.1068.S.20221104.1551.007.html.

    2. [2]

      SUN J Z,WANG J T,SU D Y,et al.Discrimination of tobacco cultivars using SCAR and RAPD markers[J].Czech J Genet Plant Breed,2020,56(4):170-173.

    3. [3]

      ZHANG H Y,LIU X Z, HE C S,et al.Random amplified DNA polymorphism of Nicotiana tabacum L.cultivars[J].Biologia Plantarum,2005,49:605-607.

    4. [4]

      REN N,TIMKO M P.AFLP analysis of genetic polymorphism and evolutionary relationships among cultivated and wild Nicotiana species[J].Genome,2001,44(4):559-571.

    5. [5]

      LIU X Z,HE C S,YANG Y M,et al.Genetic diversity among flue-cured tobacco cultivars on the basis of AFLP markers[J].Czech J Genet Plant Breed,2009,45(4):155-159.

    6. [6]

      张雪廷,童治军,焦芳婵,等.38份晾晒烟种质资源遗传关系的 SSR分析[J].植物遗传资源学报 2013,14(4):653-658.

    7. [7]

      MOON H S,NICHOLSON J S,LEWIS R S.Use of transferable Nicotiana tabacum L.microsatellite markers for investigating genetic diversity in the genus Nicotiana[J].Genome,2008,51(8):547-559.

    8. [8]

      GHOLIZADEH S,DARVISHZADEH R,MANDOULAKANI,B A,et al.Molecular characterization and similarity relationships among flue-cured tobacco (Nicotiana tabacum L.) genotypes using simple sequence repeat markers[J].Not Bot Horti Agrobo Cluj-Napoca,2012,40(1):247-253.

    9. [9]

      张剑锋,罗朝鹏,何声宝,等.应用SNP标记分析24份烟草品种的遗传多样性[J].烟草科技,2017,50(11):1-8.

    10. [10]

      蔡露,杨欢,王勇,等.利用GBS技术开发烟草SNP标记及遗传多样性分析[J].中国烟草科学,2018,39(5):17-24.

    11. [11]

      GRABICOSKI E M G,JACCOUD-FILHO D S,LEE D,et al.Real-Time quantitative and ion-metal indicator LAMP-based assays for rapid detection of Sclerotinia sclerotiorum[J].Plant Dis,2020,104:1514-1526.

    12. [12]

      BONNEY L C,WATSON R J,SLACK G S,et al.A flexible format LAMP assay for rapid detection of Ebola virus[J].PLoS Negl Trop Dis,2020,14(7):e0008496.

    13. [13]

      张琳,马利,丁雅苓,等.基于荧光显色的IBV LAMP检测方法研究[J].西北农林科技大学学报(自然科学版),2012,40(10):38-44.

    14. [14]

      童治军,张轲,孙浩巍,等.鉴别烟草属植物的特异PCR引物研究[J].中国烟草学报,2022,28(2):101-110.

    15. [15]

      KUO P,HENDERSON I R,LAMBING C.CTAB DNA extraction and genotyping-by-sequencing to map meiotic crossovers in plants[J].Methods Mol Biol,2022,2484:43-53.

    16. [16]

      OH T,TAKAHASHI T,KIM S,et al.CTAB enhancement of FRET in DNA structures[J].J Biophotonics,2016,9(1/2):49-54.

    17. [17]

      刘洋,何心尧,马红波,等.用CTAB-PVP法提取棉花各组织总RNA的研究[J].中国农业大学学报,2006,11(1):53-56.

    18. [18]

      张金丽,张罗霞,杨坤梅,等.改良CTAB法对山茶属植物基因组DNA提取的比较研究[J].江西农业大学学报,2017,39(4):785-791.

    19. [19]

      SIMON N,SHALLAT J,WILLIAMS-WIETZIKOSKI C,et al.Optimization of Chelex 100 resin-based extraction of genomic DNA from dried blood spots[J].Biol Methods Protoc,2020,5(1):bpaa009.

    20. [20]

      迟婧,耿丽丽,高继国,等.植物叶片基因组DNA快速提取方法[J].生物技术通报,2014(9):51-57.

    21. [21]

      URRUTIA-CABRERA D,LIOU R H,WANG J H,et al.Comparative analysis of loop-mediated isothermal amplification (LAMP)-based assays for rapid detection of SARS-CoV-2 genes[J].Sci Rep,2021,11:22493.

    22. [22]

      贾蒙骜,陈兴江,林叶春,等.基于环式等温扩增的烟草青枯病病原菌快速检测方法[J].中国农业大学学报, 2014,19(1):93-98.

    23. [23]

      张吉红,陈先锋,孙辉.逆转录环介导等温扩增技术检测烟草环斑病毒的研究[J].植物病理学报,2014,44(6):629-633.

    24. [24]

      吴娜,李淑君,康业斌.烟草疫霉菌LAMP检测方法的建立及验证[J].中国烟草科学,2020,41(1):74-80.

    25. [25]

      TANG Y,YEH Y T,CHEN H,et al.Comparison of four molecular assays for the detection of Tembusu virus[J].Avian Pathology,2015,44(5):379-385.

    1. [1]

      李敏贺姗姗杨钰雯 . 改良QuEChERS方法结合超高效液相色谱测定火腿肠中杂环胺类化合物. 轻工学报, 2024, 39(5): 60-70. doi: 10.12187/2024.05.007

    2. [2]

      章存勇庄海锋时雅琪邹鹏丁乃红纵坤贾良元郭东锋 . 国内外雪茄烟叶热解产物差异性研究. 轻工学报, 2024, 0(0): -.

    3. [3]

      章存勇庄海锋时雅琪邹鹏丁乃红纵坤贾良元郭东锋 . 国内外雪茄烟叶热解产物差异性研究. 轻工学报, 2024, 39(5): 118-126. doi: 10.12187/2024.05.014

    4. [4]

      池哲翔廖敏史尚李声毅廖芸丁冬 . 国外烟草活性成分提取及纤维材料利用现状与展望. 轻工学报, 2024, 0(0): -.

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  • 收稿日期:  2022-12-17
通讯作者: 陈斌, bchen63@163.com
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    沈阳化工大学材料科学与工程学院 沈阳 110142

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张轲, 杨金初, 赵旭, 等. 基于烟草属特异性基因Ntsp151的环介导等温扩增检测[J]. 轻工学报, 2023, 38(2): 110-117. doi: 10.12187/2023.02.014
引用本文: 张轲, 杨金初, 赵旭, 等. 基于烟草属特异性基因Ntsp151的环介导等温扩增检测[J]. 轻工学报, 2023, 38(2): 110-117. doi: 10.12187/2023.02.014
ZHANG Ke, YANG Jinchu, ZHAO Xu, et al. Detection of loop-mediated isothermal amplification based on Nicotiana-specific gene Ntsp151[J]. Journal of Light Industry, 2023, 38(2): 110-117. doi: 10.12187/2023.02.014
Citation: ZHANG Ke, YANG Jinchu, ZHAO Xu, et al. Detection of loop-mediated isothermal amplification based on Nicotiana-specific gene Ntsp151[J]. Journal of Light Industry, 2023, 38(2): 110-117. doi: 10.12187/2023.02.014

基于烟草属特异性基因Ntsp151的环介导等温扩增检测

    作者简介:张轲(1982-),男,吉林省长春市人,云南省烟草质量监督检测站农艺师,博士,主要研究方向为制烟原料鉴别检验技术。E-mail:swukirk@126.com
  • 1. 云南省烟草质量监督检测站, 云南 昆明 650106;
  • 2. 河南中烟工业有限责任公司 技术中心, 河南 郑州 450000;
  • 3. 云南省烟草农业科学研究院/烟草行业烟草生物技术育种重点实验室/国家烟草基因工程研究中心, 云南 昆明 650021;
  • 4. 郑州轻工业大学 食品与生物工程学院, 河南 郑州 450001
基金项目:  云南省烟草专卖局(公司)重点项目(2020530000241034);河南中烟工业有限责任公司科技计划项目(ZW2015012)

摘要: 针对烟草属特异性基因Ntsp151序列保守区设计环介导等温扩增(LAMP)引物,基于SYBR Green I荧光染料对烟草材料进行可视化LAMP检测,对检测过程中的DNA提取方法和反应条件进行优化,并对LAMP反应体系的特异性和灵敏度进行评价。结果表明:使用Chelex-100提取的DNA可以直接进行LAMP扩增反应,显色效果较好;LAMP最适反应条件为扩增温度63 ℃、反应时间60 min、Mg2+浓度6 mmol/L;LAMP对17份非烟草材料和1份烟草材料基因组DNA的扩增显色结果与荧光值的检测结果一致,具有较好的特异性,其最低检测限为102 copies/μL。基于烟草属特异性基因Ntsp151的LAMP检测结果可视化强,且灵敏度高、特异性强,适用于现场抽检。

English Abstract

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